西药是纯而又纯的单体，结构清楚，作用于靶点单一。有人提出中药多靶点作用，其实是不合适的：中药用于调整而非对抗。西药由于作用单一，局部对抗，毒副作用就大，历史上多次重大药害事故就说明了这一点，近年淘汰的PPA又是一例;而一年前英国罗氏公司产生的治疗禽流感的达菲这种药，引起儿童出现精神紊乱、抑郁现象的事件;还有就是我国有近一半的听力障碍者，均与西药抗菌药物滥用有直接关系。这些都能再一次证明西药之毒、副作用是其不可克服的一大弱点：“食至精则有害，药至精则有毒”。
不仅药物本身有毒性，也有医生滥用造成的不良反果。相反，只要辨证论治，配伍得当，中药几乎没有什么毒、副作用。临床上一些中药出现副作用，甚至毒性，原因是医师没有用到合适的病人身体上。比如说，西药研究认为，人参是无毒中药，但事实上，中国历史上将人参用于热邪蕴盛的高烧患者，而致其人死亡的案例却大有人在。说中药附子有毒，但笔者用半斤(250克)附子却治愈了3例乡村亡阳虚脱的患者(城里的这类患者都被120急救车带到急诊室输液、吸氧、输血去了)。一句话，中药的毒、副作用主要出在大夫辨证不准确上，西药的毒、副作用则在药物本身，也在大夫的不当使用。也就是说，中药的毒、副作用“在医不在药”，西药毒、副作用“在医也在药”。由此可见，中药的毒、副作用是可以控制的，而西药的毒、副作用则是无法控制或者说是难以控制的。
中医认为，是药三分毒，讲究“中病即止”，从不主张长期大量用药完全靠药物去治愈疾病，而是希望在疾病消失得差不多时，人体自身可以调动自己的康复机能，恢复健康。几千年来，没有哪种中药因毒、副作用被淘汰。如《黄帝内经素问•五常政大论篇》云“帝曰：有毒无毒，服有约乎?岐伯曰：病有久新，方有大小，有毒无毒，固宜常制矣。大毒治病，十去其六;常毒治病，十去其七;小毒治病，十去其八;无毒治病，十去其九。谷肉果菜，食养尽之，无使过之，伤其正也。”说的就是中医治病用药的原则和道理。西方人不懂，让人天天大量吃关木通等(里面还加了大量西药)以减肥，出了问题，又说含马兜铃酸的中药有毒，能导致“中草药肾病”，并以此攻击中医中药。外国人不懂情有可原，也有同胞为之佐证，只能说明这位同胞并不懂中医中药，也不懂“中药之害在医不在药”，其在他乡行医治病不就是一位真正的“庸医”。
另外，中医认为，中药的毒性也正是中药的疗效所在，提倡“以毒攻毒”治病的思想。药物毒性对于正常的人体是毒、副作用，但对于患病的身体却是治疗作用，也就是说，中药是毒、副作用还是治疗作用，是要视病情、视人体情况而定的。西药则不同，其治疗作用和毒、副作用是分开的，在治病的同时，必定伤害部分身体。大家可能都知道，美国认为安宫牛黄丸含有朱砂，而朱砂含汞，有毒，严禁进口。安宫牛黄丸确实不符合西药的标准，既含汞，又没有质量控制指标。然而，我们却不能削足适履地去适应美国标准，因为安宫牛黄丸根本不可能达到标准。退一万步说，勉强达到了西药标准，也扔掉了中药特色，不再是中药了，药效自然也不理想了。但是，我们的安宫牛黄丸却非常安全，非常有效，从来没有人因为吃了安宫牛黄丸出现汞中毒。前几年，被英国权威专家判断为“脑死亡”的香港凤凰卫视女主播刘海若，在北京宣武医院经几个月治疗，不仅已转危为安，从能吃、能说、能写字，到现在能正常工作和生活。使刘海若“起死回生”的中医中药，其中的王牌却是不符合西药标准，被美国禁止进口的安宫牛黄丸。而韩国某药商生产牛黄清心丸去掉了朱砂，他们自己却跑到同仁堂购买含朱砂的牛黄清心丸自用，说没有朱砂没有效果。
