蛛网膜囊肿是一种比较严重的疾病，因为这种疾病出现在人的大脑里面，所以治疗起来非常难，直到今天还没有完全有效的方法，甚至治疗方法还有争议，但一些方法还是值得尝试的。
一、蛛网膜囊肿的治疗仍存在争论。对无颅内压增高症状或局灶症状者有主张保守治疗，因为手术探查和囊肿切除可并发术后血肿和感染，甚至死亡。另一方面，观察到蛛网膜囊肿病人轻度脑外伤易引起颅内出血，有主张对无症状者亦需手术。
二、对无颅内压增高症状或局灶症状者有主张保守治疗，因为手术探查和囊肿切除可并发术后血肿和感染，甚至死亡。另一方面，观察到蛛网膜囊肿病人轻度脑外伤易引起颅内出血，有主张对无症状者亦需手术。目前较为统一的手术适应证为：①囊肿增大，合伴脑积水，或合伴硬膜下血肿引起的颅内压增高症状；②囊肿相关的局灶神经症状或癫痫。
三、手术分直接手术和间接手术两种。前者通过开颅或内镜手术将囊壁切除或将囊肿与蛛网膜下腔、脑室交通；后者使用分流装置将囊液引流至腹腔。囊壁切除术理论上最为合理，但因囊壁与正常神经结构严密粘连，很少能全切除囊壁。
四、对于有手术适应症的可采取手术治疗，目前主要的手术方式有：
（1）显微镜下切除蛛网膜囊肿壁并行蛛网膜囊肿和蛛网膜下腔或脑池造瘘术。
（2）蛛网膜囊肿-腹腔分流术。
（3）立体定向囊肿脑池造瘘术。
（4）神经内镜下蛛网膜囊肿壁部分切除+囊肿-脑池造瘘术和（或）囊肿-蛛网膜下腔造瘘术。
