病因尚未完全阐明，现认为可能由一种或多种病原微生物或寄生虫引起的慢性小肠感染，与麦胶饮食无明确关系。本病有流行性、季节性，广谱抗生素治疗有效，但粪便、小肠内容物以及肠黏膜中未发现病原菌。营养缺乏，如蛋白质、维生素B族、叶酸等可能与本病发病有关。
热带口炎性腹泻常常出现贫血、低白蛋白血症、葡萄糖耐量不正常等并发症。伴有消瘦、乏力、贫血、水肿等。高热、呕吐，继而大便频频，以致失禁、痢下鲜紫脓血、腹痛剧烈、里急后重感显著，更甚者津液耗伤、四肢厥冷、神志昏蒙、呕吐频繁、惊厥频频、舌质红绛、舌苔黄燥、脉滑数或微细欲绝。
患者有乏力、腹痛、腹泻，大便每日1～2次或十几次、粪便量大、呈糊状、色淡恶臭、油腻泡沫状。约30％的病例有脂肪泻、低白蛋白血症，口服蛋白耐量试验显示吸收延缓。50％的病人有葡萄糖耐量不正常，约90％的病例木糖吸收试验尿排出量减少。维生素A及B12吸收试验亦不正常。
患者合理膳食，食物摄入种类应多而营养丰富适当补液，纠正电解质平衡失调过多不易消化并加重胃肠道负担，刺激胃肠蠕动加重腹泻故植物油也应限制，并注意烹调方法，以蒸、煮、氽、烩、烧等为主，禁用油煎炸、爆炒、滑溜等可用食物有瘦肉、鸡、虾、鱼、豆制品等注意少渣，粗纤维多的食物能刺激肠蠕动，使腹泻加重，当腹泻次数多时最好暂时不吃或尽量少吃蔬菜和水果，可给予鲜果汁、番茄汁以补充维生素；少渣饮食可减少肠蠕动、减轻腹泻，故宜进食细挂面、粥、烂饭等
热带口炎性腹泻应该做小肠活组织病理检查、维生素A及B12吸收试验、木糖吸收试验、葡萄糖耐量试验、口服蛋白耐量试验。
热带口炎性腹泻患者饮食宜易消化、少渣宰，并忌食生冷食物。红枣、淮山药、栗子、扁豆、糯米、莲子肉有健脾厚肠止泻作用，不妨多吃点。苹果能止泻，煮熟后也可多吃。热带口炎性腹泻患者忌吃生大蒜，大蒜的辛辣会刺激肠壁，加剧腹泻。忌食生冷食物。
首先给予营养丰富的饮食，适当补液，纠正电解质平衡失调。腹泻次数过多者给予止泻剂。维生素B12、叶酸治疗时间要持续一年。同时给予抗生素治疗，口服四环素250～500mg，4/d，共1个月，随后改为2/d，共5～6个月。应用磺胺类药同样有效，琥磺噻唑（sulfasuxidine）1.0g，4/d，口服1个月，后改为2d，共5个月。经过治疗后贫血及舌炎迅速恢复，食欲好转，体重增加，肠粘膜病变有改善，肠粘膜酶活力增加。有些病例对治疗反应很慢，症状及吸收不良持续很长时间，因此治疗时间要长。