本病的基本病变全身小血管炎。幼虫叮咬的局部，因毒素损害、小血管形成栓塞、出现丘疹、水泡、坏死出血后成焦痂，痂脱即成溃疡。全身表浅淋巴结肿大，尤以焦痂附近的淋巴结最为明显。肝脾可因充血及单核吞噬细胞增生而增大。并可出现心肌炎、出血性肺炎、脑膜炎、间质性肾炎等。
病原体从恙螨幼虫叮咬处侵入人体，先在叮咬局部组织细胞内繁殖，引起局部的皮肤损害，继而直接或经淋巴系统进入血流，形成恙虫病东方体血症。血流中的病原体到达身体各器官组织，侵入血管内皮细胞和单核细胞吞噬细胞内生长繁殖。恙虫病死亡后所释放的毒素是引起全身毒血症状和多脏器病变的主要因素。
(1)病原：恙虫病东方体，恙虫病东方体具有与变形杆菌OXk共同抗原成分的耐热多糖抗原，临床上常用变形杆菌OXk为抗原作凝集试验协助诊断。
(2)传染源：鼠类。
(3)传播途径：恙螨幼虫是本病传播媒介。
(4)易感人群：人群对本病均易感，但患者以青壮年居多。感染后免疫期仅持续数月，最长达10个月;且只能获得对原株病原体的免疫力，故可再次感染不同株而发病。
(5)流行特征：本病流行有明显季节性与地区性。南方以6～8月为流行高峰，北方则以10、11月为高发季节。
恙虫病患者易并发肺炎。病理恙虫病东方次体入侵内皮细胞，引起血管炎。未治病例的严重病变主要是心肌炎、脑膜脑炎和肺炎。凝血障碍亦有，但不像RMSF和斑疹伤寒那样严重。恙螨叮咬处发生的丘疹性损害，溃烂即为焦痂，伴有局部并继以全身淋巴结病。
恙虫病还可引起支气管肺炎、脑炎、胸膜炎、中耳炎、腮腺炎、流产、血栓性静脉炎、DIC、感染性休克等，偶有各处出血，血管内溶血等，国内所见的并发症较少，以支气管肺炎和心血管功能不全较多见。
恙虫病患者的潜伏期为4～20天，常为10～14天。本病一般无前驱症状，多突然起病，体温迅速上升，达39～41℃，呈持续热型，弛张热型或不规则热型，持续1～3周。于发热的同时，多伴有畏寒或寒战、剧烈头痛、全身酸痛、疲乏、嗜睡、食欲下降、恶心、呕吐、颜面潮红、眼结膜充血、畏光、失眠和咳嗽等，个别病例还可有眼眶疼痛。严重者可出现烦躁、谵妄、听力减退、强直性痉挛、嗜睡和昏迷等，可出现脑膜刺激征及病理神经反射。主要体征包括：
1、焦痂与溃疡
为本病之特征，可见于70％～100％患者。人被受恙虫病立克次体感染的恙螨幼虫叮咬后，局部随后出现红色丘疹，不痛不痒，继成水疱，然后发生坏死和出血，随后结成黑色痂皮，称为焦痂。其边缘突起，周围有红晕，呈圆形或椭圆形，大小不等，直径可为2～15mm，多为4～10mm;痂皮脱落后即成溃疡，其基底部为淡红色肉芽组织，起初常有血清样渗出液，随后逐渐减少，形成一个光洁的凹陷面，偶有继发性化脓现象。多数患者仅有1个，偶见2～3个焦痂或溃疡，亦有多至11个的报告。由于恙螨幼虫好侵袭人体的潮湿、气味较浓以及被压迫部位，故焦痂多见于腋窝、阴囊、外生殖器、腹股沟、会阴、肛周和腰带压迫等处，但头、颈、胸、背、腹、乳房和四肢等部位亦有发现。由于焦痂是恙螨幼虫叮咬、恙虫病立克次体入侵人体的部位，故理论上每个恙虫病患者都应有焦痂。约有30％的患者于洗澡、更衣时，可发现不痛不痒或稍带痒感的焦痂，而且常于发病前1～2周已发现。
2、淋巴结肿大
焦痂附近的淋巴结常明显肿大，并常伴疼痛和压痛。全身浅表淋巴结肿大者也相当常见。一般大者如鸽蛋，小者如蚕豆，可移动，多见于腹股沟、腋下、耳后等处，消肿较慢，常于疾病的恢复期仍可扪及。
3、皮疹
出现于病程的第2～8天，较多见于第4～6天，少数病例可于发病时即出现皮疹,或迟至第14天才出现皮疹。发生率各地报告差别较大(35.34％～100％)，可能与就诊时病期不同有关。皮疹多呈暗红色充血性斑丘疹，也有呈出血性者，无痒感，大小不一，直径为2～5mm，多散布于躯干部，向四肢发展，面部很少，手掌和脚底部更少，极少数可融合呈麻疹样皮疹，多经3～7天后逐渐消退，不脱屑，但有色素沉着。有时，于病程第7～10天可在口腔软、硬腭及颊部黏膜上发现黏膜疹或出血点。
有些流行区出现一些轻型患者，其临床表现为发热、头痛，皮疹和淋巴结肿大。这些患者可能是过去曾被不同血清型恙虫病立克次体感染过的人，有一定交叉免疫力。
4、肝脾肿大
肝肿大约占10％～30％，脾肿大约占30％～50％，质软，表面平滑，无触压痛。
5、其他
舌尖、边常红色，伴白色或黄色厚苔。眼结膜充血为常见体征之一，同时约5％患者可有结膜下出血。眼底可见静脉曲张，视盘边缘模糊、水肿，也可见眼底出血。部分患者皮肤充血，故有颜面及全身皮肤潮红现象。心肌炎较常见，心率可达120次/min以上，心音、脉搏皆弱，心电图可呈T波低平或倒置，或发生传导阻滞现象。重型患者可发生心力衰竭与循环衰竭。肺部体征依病情轻重而异，轻者可无明显体征，重型患者可发生间质性肺炎，以呼吸困难为主，可出现发绀现象。若有继发性细菌感染，则可闻干、湿性?音。此外，亦可发生全身性感觉过敏、睾丸肿痛、阴囊肿大压痛、腰痛和腹胀等现象。
危重病例呈严重的多器官损害，出现心、肾衰竭、循环衰竭与出血现象，如鼻出血、胃肠道出血等，还可发生弥散性血管内凝血。若患者的病程达15天以上，则病情常较严重，表现为明显的多器官损害，心、肝、肾衰竭，出现休克、氮质血症、出血倾向和昏迷。
二战期间及其后，已在开发和试验疫苗有些对同源株有效但尚无一种抗原对所有抗原性不同的恙虫病东方次体株，都能诱导保护作用疫区部队可以每周1剂多西环素的方法，防止丛林斑疹伤寒
防止恙螨附身，皮肤可用驱虫剂，或穿用苯甲酸苄酯浸渗的防护服二乙甲苯酰胺制剂如OFF、DEET等喷雾(用于服装或裸露皮肤)亦有效，但遇水即迅速消失防止恙螨叮咬，这些化学药品其实更宜施用于衣服
1、切断传播途径铲除杂草，改造环境，消灭恙螨孳生地是最根本措施，流行区野外作业时，应铲除或焚烧住地周围50米以内的杂草，然后喷洒1～2％敌敌畏，亦可用40％乐果乳剂或5％马拉硫磷乳剂配成1‰溶液以20～25ml/m2计算渍洒地面
2、个人防护避免在溪边草地上坐卧，在杂草灌丛上晾晒衣服，在流行区野外军事训练，生产劳动，工作活动时，应扎紧袖口，领口及裤脚口，身体外露部位涂擦5％的邻苯二甲酸二甲脂(即避蚊剂)，邻苯二甲酸二苯酯，苯甲酸苄酯或硫化钾溶液
3、消灭传染源主要是灭鼠，应发动群众，采用各种灭鼠器与药物相结合的综合措施灭鼠
4、目前尚无可供使用的有效疫苗，进入重疫区的人员，可服强力霉素0.1～0.2g或氯霉素1g，隔日1次，连用4周
5、以防恙螨幼虫叮咬，回营区后及时沐浴，更衣，如发现恙螨幼虫叮咬，可立即用针挑去，涂以酒精或其他消毒剂
恙虫病患者如不治疗，死亡率0～30％不等，决定于毒力和抗御因素，经过治疗，预计无死亡。所以本病需早检查早诊断早治疗。
1、血象
白细胞总数多减少，亦可正常或增高;分类常有核左移。
2、血清学检查
⑴外斐反应 患者单份血清对变形杆菌OXk凝集效价在1:160以上或早晚期双份血清效价呈4倍增长者有诊断意义。最早第4天出现阳性，3～4周达高峰。
⑵补体结合试验 应用当地代表株或多价抗原，特异性高，抗体持续时间长。
⑶间接免疫荧光试验测定血清抗体 于起病第1周末出现抗体，第2～3周末达高峰，对流行病学调查意义较大。
⑷酶联免疫吸附试验 可作各种血清型恙虫病东方体的特异性IgM或IgG血清学检查。
3、病原体分离
必要时取发热期患者血液0.5ml，接种小白鼠腹腔，小白鼠于1～3周死亡，剖检取腹膜或脾脏作涂片，经吉姆萨染色或荧光抗体染色镜检，于单核细胞内可见东方体。也可作鸡胚接种、组织培养分离病原体。
恙虫病患者应给予易消化，少纤维的营养丰富饮食。发热期可给流质或半流质饮食，多饮水;恢复期患者食欲好转明显，可开始进食稀饭和软饭，然后逐渐恢复正常饮食。
(1)发热期
饮食处方：营养丰富清淡的流质饮食，每日六餐。7：00稀藕粉200ml，9：00果汁100 ml，12：00肉汤150ml，15：O0果汁100ml，17：00鸡汤15ml，19：00稀藕粉100ml。
(2退热期和高热期
饮食处方：无渣不产气的半流质，每日五餐。7：00稀米饭200ml，10：00果汁或菜汁150ml，12：00鸡蛋羹50g，米粥50ml，15：00米粥100ml，菜汁50ml，18：00肉末软面条100g。
(3恢复期
易消化软食逐渐至正常饮食，禁生冷、油腻、辛辣食物。
恙虫病患者应注意休息，避免劳累。可进食流质或半流质易被消化吸收的食物。补充B族维生素和维生素C。保持大便畅通，尿量为2000ml/d左右。对恙虫病患者越早诊治，疗效越好。然而，当恙虫病患者的病程进入第2周后，临床表现则显著加重，出现多器官功能损害和明显的出血倾向。当病程进人第3周后，除病情明显加重外，抗菌药物治疗的疗效亦较差，患者的体温常需3～5天才能逐渐降至正常。少数患者可出现复发。复发时不再出现焦痂，应用与首次发病相同的抗菌药物治疗同样有效。可酌情选用下列抗菌药物治疗：
1、大环内酯类
包括红霉素(erythromycin)、罗红霉素(roxithromycin)、阿奇霉素(azithromycin)、克拉霉素(克拉红霉素)等，对恙虫病有良好疗效。对儿童患者和妊娠患者，宜选用大环内酯类作病原治疗，如阿奇霉素、罗红霉素等。红霉素的常用剂量为成人1.2g/d，儿童25～30mg/(kg?d)，每天分3次或4次服用，或分2次或3次静脉滴注。罗红霉素的常用剂量为成人300mg/d，儿童体重12～23kg者，100mg/d，24～40kg者，200mg/d，分2次口服，首次剂量可加倍。阿奇霉素，成人剂量为0.25g，1次/d，口服，首次剂量可加倍。克拉霉素的常用剂量为成人500mg，2次/d，口服，退热后可改为每次口服250mg。患者多于用药后24h之内快速退热，疗程均为8～10天。明显肝功能损害者不宜应用大环内酯类。
2、氯霉素
氯霉素(chloramphenicol)对恙虫病有良好疗效。常用剂量为成人2g/d，儿童25～40mg/(kg?d)。每日剂量可作静脉滴注或分4次口服，患者多于用药后24h之内快速退热，退热后剂量减半，继续用7～10天，以免复发。因氯霉素抑制骨髓造血功能，有诱发再生障碍性贫血的可能性，故不宜作为本病的首选治疗药物。肝肾功能不全者使用氯霉素还会加重肝肾功能损害，应密切留意病情变化，如有异常应及时报告医生。幼儿、孕妇和哺乳期妇女不宜应用氯霉素。
3、喹诺酮类
包括氧氟沙星(ofloxacin)、环丙沙星(ciprofloxacin)、培氟沙星(pefloxacin)、氟罗沙星(fleroxacin)、洛美沙星(lomefloxacin)、依诺沙星(enoxacin)、司帕沙星(spara)等。目前较常用的是氧氟沙星和环丙沙星。氧氟沙星成人剂量为0.2g/次，2次/d，口服，首日可加服1次。环丙沙星成人剂量为0.25g/次，2次/d，口服，首日可加服1次。必要时可作静脉滴注，疗程均为8～10天。8岁以下的儿童、孕妇和哺乳期妇女不宜应用喹诺酮类。
4、四环素类
包括四环素(tetracycline)、多西环素(doxycycline)、米诺环素(minocycline)等，对恙虫病亦有良好疗效。四环素的常用剂量为成人2g/d，儿童25～40mg/(kg?d)，分4次口服。多西环素的常用剂量为成人0.2g/d，儿童4mg/(kg?d)，每日服药1次或分2次服用，首次剂量可加倍。米诺环素的常用剂量为成人0.2 g/d，儿童4mg/(kg?d)，每日服药1次或分2次服用，首次剂量可加倍。疗程均为8～10天。8岁以下的儿童、孕妇和哺乳期妇女不宜应用四环素类。
在上述的四类抗菌药物中，以大环内酯类、四环素类和氯霉素对恙虫病立克次体的抑杀作用较强，患者多于用药24h后体温退至正常。应用喹诺酮类治疗亦多可使患者的体温于24～48h内降至正常。通常只需选用一种抗菌药物，无需联合应用治疗。有资料显示利福平(rifampicin)对本病亦有疗效。
另外，青霉素类，如氨苄西林(ampicillin)等，头孢菌素类，如头孢他啶(ceftazidime)等，头孢霉素类，如头孢西丁(cefoxitin)等，碳青霉烯类，如亚胺培南(imipenem)等，单环β-内酰胺类，如氨曲南(aztreonam)等和氨基糖苷类，如阿米卡星(amikacin)等抗生素对恙虫病无治疗作用。因为恙虫病立克次体是专性细胞内寄生的微生物，而这些抗生素很难进入细胞内发挥其作用，所以这些抗生素对恙虫病无治疗作用。