真菌如同其他微生物，在变态反应的发生中有其一定规律性，但因其菌体大，细胞壁富有多糖体，有较复杂的代谢过程和酶系统以及潜在的抗原性等，故又与细菌和病毒不同。真菌过敏症与下列因素有关：
1、菌种类别，变应原较强的如曲霉、链格孢等，易致过敏。
2、孢子的抗原性较菌丝强。
3、个体的敏感体质也起重要作用。
真菌的孢子和菌丝经各种途径进入人体后，都有可能引起过敏反应。真菌过敏症可能会导致继发性细菌或真菌性角膜感染等并发症。
真菌过敏症在临床上皮肤和呼吸道为主要反应器官。皮肤表现有过敏性皮炎、湿疹、遗传过敏性皮炎、荨麻疹、痒疹、瘙痒症、癣菌疹（可呈汗疱疹样、湿疹样、丹毒样、多形红斑样、脂溢性皮炎样、银屑病样、玫瑰糠疹样、以至红皮病样等表现，而以汗疱疹最为常见）等。呼吸道表现有哮喘、过敏性鼻炎、农民肺等。此外尚有胃肠道、神经系统（如周期性偏头痛）的过敏反应等。
有过敏体质的朋友在体质调理前后，虾、蟹、贝类及冰冷饮料须尽量避免，以免症状复发，影响治疗的效果，并且须注意避免过敏原的刺激，平时多加运动，放松身心以增强免疫力，过敏体质必定会有显著的改善通过先进的检测技术准确找到过敏原，明确过敏原后，在日常生活中主动避免接触
真菌过敏症最有效措施是寻找出过敏诱发因子，避免再接触这种物质，但要在2万种不同的诱发因子中准确地找到致病的因子，不是件容易的事情。为检测一种物质的致敏反应，医生需要做各种不同的皮肤测试，费时费事，更因为许多致敏物质是不可以完全避的，比如药物和昆虫等防不胜防。
有过敏体质的患者在体质调理前后，虾、蟹、贝类及冰冷饮料、食品须尽量避免，以免症状复发，影响治疗的效果。真菌过敏症患者应注意饮食清淡富于营养，多吃新鲜的蔬菜和水果。新鲜的蔬菜和水果含有大量人体所需的营养成分。患者还应多吃提高免疫力的食物，以提高机体抗病能力。
真菌过敏症的治疗首先要去除致敏真菌（如治疗有关真菌病，停用致敏抗生素等），使用抗组胺类药物及对症治疗，重者可用肾上腺皮质激素。